Naukowcy MCB i UJ CM opublikowali kolejne sekwencje SARS-Cov-2 od polskich pacjentów


Naukowcy z Małopolskiego Centrum Biotechnologii we współpracy z badaczami z Uniwersytetu Jagiellońskiego - Collegium Medicum oraz Wojewódzką Stacją Sanitarno-Epidemiologiczną w Krakowie opracowali sekwencje wirusów SARS-CoV-2 wyizolowanych bezpośrednio od polskich pacjentów.


Sukces ten należy aż do trzech grup, ViroGenetics - BSL3 Laboratory of Virology, Human Genome Variation Research Group, Bioinformatics Research Group, których liderami są odpowiednio prof. Krzysztof Pyrć, prof. Wojciech Branicki i dr hab. Paweł Łabaj.

Badania prowadzone są we współpracy z zespołem prof. Marka Sanaka, kierownika Zakładu Biologii Molekularnej i Genetyki Klinicznej UJ CM

– Koronawirus wywołuje ciężkie zapalenie płuc o często nieodwracalnych skutkach. Wydaje się, że mechanizm zakażenia, który powoduje powstanie ciężkich stanów chorobowych, czyli ok. 20% przypadków, a u niektórych pacjentów prowadzi do śmierci, dotyczy to w tej chwili to ok. 2%, głównie spośród chorych w wieku ponad 70 lat, wynika z nieprawidłowej odpowiedzi odpornościowej organizmu – wyjaśniał prof. Marek Sanak podczas konferencji prasowej, na której poinformowano o przekazaniu przez MNiSW 25 mln PLN na wspólne badania naukowców z UJ i UJ CM, których celem jest walka z koronawirusem. – Będziemy identyfikować cząsteczki wywołujące nieprawidłową odpowiedź organizmu w momencie zakażenia, które rozpoczyna się w nabłonku dróg oddechowych. Wśród śmiertelnych przypadków zakażenia koronawirusem obserwowano spadek poziomu limfocytów – komórki odpornościowe napływały  wielkich ilościach do płuc i wyłączały funkcje tego organu. W takiej sytuacji nie pomaga krążenie pozaustrojowe, nie pomagają ani dotychczas stosowane leki, ani terapie podtrzymujące.

Opracowane sekwencje wirusów są najbliżej spokrewnione ze szczepami pochodzącymi z Anglii, jak wykazała analiza z użyciem bazy danych nextstrain, w której znajduje się ponad 9500 sekwencji wirusa uzyskanych w różnych regionach świata. Sekwencje opracowane w MCB przy zastosowaniu technologii AmpliSeq (Thermo Fisher Scientific) udostępnione zostały w bazie danych GISAID i są dostępne na stronie https://nextstrain.org/ncov/global?f_country=Poland.


Data publikacji: 24.04.2020



Powrót